Het meer, dat genesteld ligt in de Wright-vallei tussen de Asgard Mountain Range en het Olympus-gebergte, is 18 keer zouter dan de oceaan en twee keer zo zout als de Dode Zee. Ook al ligt het meer in een van de koudste regio's van Antarctica, het is zo zout dat het nooit bevriest tot min 40 graden Celcius.
Men denkt dat het Don Juanmeer zijn zout krijgt van grondwaterstroming vanaf de basis van de Olympus en Asgard bergen, en mineralen oplost uit omliggende rotsen. Recentere studies van geologen van de Brown University geven echter aan dat het Don Juanmeer zijn zout krijgt van de neerslag, niet uit grondwater.
Het meer is vernoemd naar twee helikopterpiloten, Don Roe en John Hickey, die het meer ontdekten in 1961.